Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMB2P55268 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LAMB2P55268 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LAMB2P55268 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMB2P55268 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LAMB2P55268 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAMB2P55268 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAMB2P55268 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMB2P55268 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMB2P55268 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMB2P55268 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMB2P55268 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMB2P55268 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LAMB2P55268 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LAMB2P55268 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMB2P55268 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMB2P55268 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
LAMB2P55268 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LAMB2P55268 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LAMB2P55268 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMB2P55268 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LAMB2P55268 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LAMB2P55268 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMB2P55268 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMB2P55268 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAMB2P55268 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LAMB2P55268 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
LAMB2P55268 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LAMB2P55268 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LAMB2P55268 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMB2P55268 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMB2P55268 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMB2P55268 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LAMB2P55268 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LAMB2P55268 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LAMB2P55268 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAMB2P55268 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAMB2P55268 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAMB2P55268 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms