Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOSBP53539 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOSBP53539 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOSBP53539 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOSBP53539 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOSBP53539 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOSBP53539 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOSBP53539 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOSBP53539 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOSBP53539 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOSBP53539 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FOSBP53539 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOSBP53539 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOSBP53539 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOSBP53539 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOSBP53539 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOSBP53539 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOSBP53539 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOSBP53539 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
FOSBP53539 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOSBP53539 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOSBP53539 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOSBP53539 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOSBP53539 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOSBP53539 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOSBP53539 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
FOSBP53539 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
FOSBP53539 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOSBP53539 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOSBP53539 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOSBP53539 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOSBP53539 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOSBP53539 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOSBP53539 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOSBP53539 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOSBP53539 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
FOSBP53539 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOSBP53539 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOSBP53539 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
FOSBP53539 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOSBP53539 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOSBP53539 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOSBP53539 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
FOSBP53539 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
FOSBP53539 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOSBP53539 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOSBP53539 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOSBP53539 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOSBP53539 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOSBP53539 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FOSBP53539 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
FOSBP53539 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FOSBP53539 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
FOSBP53539 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOSBP53539 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOSBP53539 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FOSBP53539 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
FOSBP53539 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOSBP53539 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOSBP53539 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FOSBP53539 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FOSBP53539 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FOSBP53539 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
FOSBP53539 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FOSBP53539 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
FOSBP53539 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOSBP53539 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOSBP53539 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOSBP53539 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOSBP53539 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOSBP53539 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOSBP53539 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOSBP53539 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOSBP53539 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOSBP53539 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOSBP53539 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOSBP53539 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOSBP53539 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOSBP53539 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOSBP53539 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOSBP53539 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOSBP53539 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOSBP53539 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOSBP53539 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOSBP53539 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOSBP53539 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOSBP53539 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOSBP53539 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOSBP53539 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOSBP53539 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOSBP53539 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOSBP53539 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOSBP53539 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOSBP53539 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FOSBP53539 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOSBP53539 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOSBP53539 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOSBP53539 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
FOSBP53539 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOSBP53539 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms