Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCT8P50990 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCT8P50990 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCT8P50990 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCT8P50990 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCT8P50990 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT8P50990 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT8P50990 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT8P50990 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT8P50990 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT8P50990 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCT8P50990 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCT8P50990 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCT8P50990 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCT8P50990 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCT8P50990 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCT8P50990 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCT8P50990 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCT8P50990 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCT8P50990 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCT8P50990 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCT8P50990 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCT8P50990 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCT8P50990 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCT8P50990 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCT8P50990 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCT8P50990 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCT8P50990 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT8P50990 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT8P50990 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT8P50990 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT8P50990 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT8P50990 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT8P50990 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCT8P50990 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT8P50990 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT8P50990 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT8P50990 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT8P50990 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT8P50990 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT8P50990 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT8P50990 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT8P50990 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCT8P50990 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCT8P50990 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT8P50990 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT8P50990 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT8P50990 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT8P50990 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT8P50990 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT8P50990 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT8P50990 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT8P50990 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCT8P50990 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCT8P50990 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCT8P50990 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCT8P50990 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCT8P50990 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCT8P50990 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCT8P50990 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCT8P50990 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCT8P50990 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCT8P50990 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCT8P50990 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCT8P50990 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCT8P50990 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCT8P50990 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCT8P50990 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCT8P50990 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCT8P50990 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCT8P50990 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCT8P50990 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCT8P50990 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCT8P50990 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT8P50990 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT8P50990 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT8P50990 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT8P50990 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCT8P50990 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCT8P50990 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCT8P50990 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCT8P50990 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCT8P50990 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCT8P50990 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCT8P50990 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCT8P50990 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCT8P50990 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCT8P50990 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCT8P50990 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCT8P50990 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCT8P50990 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCT8P50990 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCT8P50990 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCT8P50990 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCT8P50990 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCT8P50990 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCT8P50990 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCT8P50990 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCT8P50990 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCT8P50990 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms