Protein–RNA interactions for Protein: P49589

CARS, Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARSP49589 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARSP49589 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARSP49589 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARSP49589 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARSP49589 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARSP49589 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARSP49589 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARSP49589 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARSP49589 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CARSP49589 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARSP49589 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARSP49589 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CARSP49589 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARSP49589 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARSP49589 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARSP49589 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARSP49589 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARSP49589 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARSP49589 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARSP49589 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARSP49589 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARSP49589 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARSP49589 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARSP49589 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARSP49589 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARSP49589 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARSP49589 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARSP49589 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARSP49589 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARSP49589 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARSP49589 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARSP49589 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARSP49589 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARSP49589 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARSP49589 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARSP49589 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARSP49589 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARSP49589 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARSP49589 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARSP49589 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARSP49589 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARSP49589 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARSP49589 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CARSP49589 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARSP49589 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARSP49589 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARSP49589 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARSP49589 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARSP49589 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARSP49589 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARSP49589 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CARSP49589 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARSP49589 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARSP49589 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARSP49589 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARSP49589 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARSP49589 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARSP49589 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARSP49589 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARSP49589 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARSP49589 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARSP49589 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARSP49589 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARSP49589 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARSP49589 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARSP49589 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARSP49589 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARSP49589 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARSP49589 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARSP49589 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARSP49589 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARSP49589 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARSP49589 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARSP49589 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARSP49589 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARSP49589 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARSP49589 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARSP49589 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARSP49589 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARSP49589 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARSP49589 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARSP49589 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CARSP49589 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CARSP49589 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARSP49589 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARSP49589 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARSP49589 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARSP49589 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARSP49589 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARSP49589 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARSP49589 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARSP49589 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARSP49589 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARSP49589 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARSP49589 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARSP49589 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARSP49589 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARSP49589 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARSP49589 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARSP49589 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms