Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REG1BP48304 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REG1BP48304 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REG1BP48304 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REG1BP48304 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REG1BP48304 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REG1BP48304 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REG1BP48304 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REG1BP48304 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REG1BP48304 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REG1BP48304 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REG1BP48304 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REG1BP48304 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REG1BP48304 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REG1BP48304 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REG1BP48304 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
REG1BP48304 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REG1BP48304 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REG1BP48304 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REG1BP48304 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REG1BP48304 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REG1BP48304 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REG1BP48304 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REG1BP48304 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REG1BP48304 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REG1BP48304 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REG1BP48304 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REG1BP48304 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REG1BP48304 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REG1BP48304 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REG1BP48304 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REG1BP48304 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REG1BP48304 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REG1BP48304 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REG1BP48304 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REG1BP48304 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REG1BP48304 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REG1BP48304 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REG1BP48304 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
REG1BP48304 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REG1BP48304 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REG1BP48304 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
REG1BP48304 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
REG1BP48304 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
REG1BP48304 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
REG1BP48304 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REG1BP48304 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REG1BP48304 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
REG1BP48304 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REG1BP48304 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REG1BP48304 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REG1BP48304 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REG1BP48304 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REG1BP48304 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REG1BP48304 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REG1BP48304 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REG1BP48304 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
REG1BP48304 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REG1BP48304 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REG1BP48304 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REG1BP48304 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REG1BP48304 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REG1BP48304 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REG1BP48304 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REG1BP48304 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REG1BP48304 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REG1BP48304 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REG1BP48304 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REG1BP48304 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REG1BP48304 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REG1BP48304 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REG1BP48304 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REG1BP48304 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REG1BP48304 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REG1BP48304 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REG1BP48304 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REG1BP48304 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REG1BP48304 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REG1BP48304 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REG1BP48304 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REG1BP48304 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REG1BP48304 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REG1BP48304 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REG1BP48304 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REG1BP48304 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REG1BP48304 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REG1BP48304 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REG1BP48304 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REG1BP48304 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REG1BP48304 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REG1BP48304 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
REG1BP48304 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
REG1BP48304 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REG1BP48304 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REG1BP48304 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REG1BP48304 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REG1BP48304 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REG1BP48304 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REG1BP48304 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REG1BP48304 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms