Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANBP1P43487 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP1P43487 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RANBP1P43487 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RANBP1P43487 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RANBP1P43487 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANBP1P43487 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANBP1P43487 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANBP1P43487 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANBP1P43487 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANBP1P43487 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANBP1P43487 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANBP1P43487 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANBP1P43487 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANBP1P43487 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms