Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD52P43351 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD52P43351 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD52P43351 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD52P43351 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD52P43351 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD52P43351 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD52P43351 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD52P43351 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD52P43351 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD52P43351 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD52P43351 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD52P43351 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD52P43351 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD52P43351 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD52P43351 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD52P43351 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD52P43351 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD52P43351 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD52P43351 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD52P43351 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD52P43351 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD52P43351 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD52P43351 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD52P43351 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD52P43351 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD52P43351 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD52P43351 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD52P43351 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD52P43351 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD52P43351 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD52P43351 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD52P43351 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD52P43351 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD52P43351 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD52P43351 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD52P43351 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD52P43351 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD52P43351 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD52P43351 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD52P43351 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD52P43351 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD52P43351 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD52P43351 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD52P43351 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD52P43351 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD52P43351 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD52P43351 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD52P43351 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD52P43351 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD52P43351 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD52P43351 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD52P43351 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD52P43351 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD52P43351 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD52P43351 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD52P43351 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD52P43351 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD52P43351 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD52P43351 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD52P43351 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD52P43351 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD52P43351 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD52P43351 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD52P43351 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD52P43351 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD52P43351 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD52P43351 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD52P43351 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD52P43351 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD52P43351 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD52P43351 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD52P43351 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD52P43351 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD52P43351 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD52P43351 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD52P43351 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD52P43351 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD52P43351 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD52P43351 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD52P43351 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD52P43351 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD52P43351 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD52P43351 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD52P43351 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD52P43351 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD52P43351 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD52P43351 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD52P43351 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD52P43351 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD52P43351 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD52P43351 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD52P43351 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD52P43351 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD52P43351 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD52P43351 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD52P43351 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD52P43351 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD52P43351 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD52P43351 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms