Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL13AP40429 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RPL13AP40429 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL13AP40429 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL13AP40429 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL13AP40429 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms