Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PBX3P40426 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PBX3P40426 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PBX3P40426 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PBX3P40426 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PBX3P40426 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PBX3P40426 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PBX3P40426 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PBX3P40426 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PBX3P40426 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PBX3P40426 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PBX3P40426 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PBX3P40426 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PBX3P40426 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PBX3P40426 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PBX3P40426 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PBX3P40426 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PBX3P40426 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PBX3P40426 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PBX3P40426 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PBX3P40426 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PBX3P40426 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PBX3P40426 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PBX3P40426 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PBX3P40426 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PBX3P40426 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PBX3P40426 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PBX3P40426 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PBX3P40426 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBX3P40426 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBX3P40426 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBX3P40426 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBX3P40426 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PBX3P40426 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBX3P40426 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBX3P40426 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBX3P40426 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PBX3P40426 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBX3P40426 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBX3P40426 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBX3P40426 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PBX3P40426 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PBX3P40426 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBX3P40426 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBX3P40426 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBX3P40426 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBX3P40426 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBX3P40426 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PBX3P40426 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBX3P40426 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PBX3P40426 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PBX3P40426 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PBX3P40426 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PBX3P40426 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PBX3P40426 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PBX3P40426 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PBX3P40426 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PBX3P40426 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PBX3P40426 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PBX3P40426 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PBX3P40426 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PBX3P40426 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PBX3P40426 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PBX3P40426 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PBX3P40426 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PBX3P40426 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PBX3P40426 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PBX3P40426 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PBX3P40426 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PBX3P40426 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PBX3P40426 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PBX3P40426 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PBX3P40426 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PBX3P40426 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PBX3P40426 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PBX3P40426 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PBX3P40426 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PBX3P40426 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PBX3P40426 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBX3P40426 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBX3P40426 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PBX3P40426 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBX3P40426 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PBX3P40426 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBX3P40426 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBX3P40426 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBX3P40426 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PBX3P40426 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PBX3P40426 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PBX3P40426 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PBX3P40426 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PBX3P40426 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PBX3P40426 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PBX3P40426 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PBX3P40426 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PBX3P40426 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBX3P40426 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBX3P40426 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBX3P40426 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBX3P40426 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms