Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGER1P34995 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGER1P34995 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGER1P34995 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGER1P34995 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGER1P34995 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGER1P34995 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGER1P34995 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER1P34995 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER1P34995 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGER1P34995 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGER1P34995 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGER1P34995 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGER1P34995 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGER1P34995 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGER1P34995 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER1P34995 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms