Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHRP34981 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHRP34981 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHRP34981 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHRP34981 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRHRP34981 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHRP34981 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHRP34981 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHRP34981 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRHRP34981 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHRP34981 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRHRP34981 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHRP34981 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRHRP34981 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRHRP34981 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRHRP34981 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TRHRP34981 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHRP34981 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRHRP34981 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHRP34981 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHRP34981 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHRP34981 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHRP34981 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRHRP34981 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHRP34981 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRHRP34981 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHRP34981 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHRP34981 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHRP34981 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHRP34981 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRHRP34981 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRHRP34981 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRHRP34981 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRHRP34981 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHRP34981 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHRP34981 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHRP34981 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHRP34981 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHRP34981 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRHRP34981 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHRP34981 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHRP34981 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHRP34981 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRHRP34981 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHRP34981 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRHRP34981 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHRP34981 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRHRP34981 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHRP34981 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRHRP34981 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRHRP34981 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRHRP34981 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRHRP34981 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHRP34981 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHRP34981 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHRP34981 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHRP34981 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHRP34981 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHRP34981 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRHRP34981 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRHRP34981 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHRP34981 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRHRP34981 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRHRP34981 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHRP34981 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHRP34981 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHRP34981 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRHRP34981 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRHRP34981 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHRP34981 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRHRP34981 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRHRP34981 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHRP34981 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHRP34981 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHRP34981 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRHRP34981 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRHRP34981 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRHRP34981 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRHRP34981 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRHRP34981 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRHRP34981 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHRP34981 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRHRP34981 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRHRP34981 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHRP34981 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHRP34981 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHRP34981 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRHRP34981 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRHRP34981 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHRP34981 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHRP34981 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHRP34981 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHRP34981 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHRP34981 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHRP34981 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRHRP34981 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRHRP34981 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHRP34981 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRHRP34981 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRHRP34981 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms