Protein–RNA interactions for Protein: P32929

CTH, Cystathionine gamma-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHP32929 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTHP32929 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTHP32929 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTHP32929 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTHP32929 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTHP32929 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTHP32929 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTHP32929 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTHP32929 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTHP32929 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTHP32929 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTHP32929 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTHP32929 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTHP32929 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTHP32929 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTHP32929 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTHP32929 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CTHP32929 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTHP32929 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTHP32929 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTHP32929 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTHP32929 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTHP32929 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTHP32929 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTHP32929 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTHP32929 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTHP32929 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTHP32929 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTHP32929 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTHP32929 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTHP32929 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTHP32929 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTHP32929 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTHP32929 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTHP32929 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTHP32929 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTHP32929 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTHP32929 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTHP32929 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTHP32929 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTHP32929 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTHP32929 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTHP32929 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTHP32929 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTHP32929 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTHP32929 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTHP32929 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTHP32929 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTHP32929 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTHP32929 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTHP32929 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTHP32929 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTHP32929 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTHP32929 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTHP32929 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTHP32929 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTHP32929 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTHP32929 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTHP32929 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTHP32929 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTHP32929 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTHP32929 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTHP32929 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTHP32929 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CTHP32929 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTHP32929 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTHP32929 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTHP32929 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTHP32929 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTHP32929 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTHP32929 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTHP32929 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTHP32929 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTHP32929 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTHP32929 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTHP32929 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTHP32929 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTHP32929 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTHP32929 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CTHP32929 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTHP32929 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTHP32929 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTHP32929 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTHP32929 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTHP32929 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTHP32929 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTHP32929 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTHP32929 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTHP32929 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTHP32929 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTHP32929 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTHP32929 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTHP32929 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTHP32929 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTHP32929 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTHP32929 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTHP32929 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTHP32929 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTHP32929 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTHP32929 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms