Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB1P20618 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB1P20618 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB1P20618 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB1P20618 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB1P20618 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB1P20618 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB1P20618 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB1P20618 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB1P20618 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMB1P20618 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB1P20618 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMB1P20618 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB1P20618 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMB1P20618 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB1P20618 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms