Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCN2P20062 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCN2P20062 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCN2P20062 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCN2P20062 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCN2P20062 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCN2P20062 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCN2P20062 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCN2P20062 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCN2P20062 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCN2P20062 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCN2P20062 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCN2P20062 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCN2P20062 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCN2P20062 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCN2P20062 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCN2P20062 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCN2P20062 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCN2P20062 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCN2P20062 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCN2P20062 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCN2P20062 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN2P20062 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN2P20062 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN2P20062 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCN2P20062 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCN2P20062 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCN2P20062 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCN2P20062 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCN2P20062 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCN2P20062 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCN2P20062 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCN2P20062 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCN2P20062 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCN2P20062 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCN2P20062 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCN2P20062 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCN2P20062 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCN2P20062 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCN2P20062 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCN2P20062 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCN2P20062 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCN2P20062 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCN2P20062 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCN2P20062 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCN2P20062 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCN2P20062 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TCN2P20062 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCN2P20062 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCN2P20062 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCN2P20062 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCN2P20062 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCN2P20062 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCN2P20062 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCN2P20062 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCN2P20062 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCN2P20062 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCN2P20062 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCN2P20062 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCN2P20062 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCN2P20062 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCN2P20062 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCN2P20062 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCN2P20062 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCN2P20062 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCN2P20062 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCN2P20062 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCN2P20062 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCN2P20062 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCN2P20062 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCN2P20062 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCN2P20062 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCN2P20062 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCN2P20062 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCN2P20062 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCN2P20062 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCN2P20062 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCN2P20062 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCN2P20062 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCN2P20062 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCN2P20062 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCN2P20062 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCN2P20062 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCN2P20062 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCN2P20062 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCN2P20062 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCN2P20062 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCN2P20062 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCN2P20062 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCN2P20062 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCN2P20062 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms