Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AREGP15514 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AREGP15514 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AREGP15514 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AREGP15514 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AREGP15514 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AREGP15514 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AREGP15514 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AREGP15514 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AREGP15514 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AREGP15514 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AREGP15514 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AREGP15514 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AREGP15514 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AREGP15514 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AREGP15514 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AREGP15514 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AREGP15514 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AREGP15514 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AREGP15514 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AREGP15514 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AREGP15514 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AREGP15514 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AREGP15514 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AREGP15514 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AREGP15514 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AREGP15514 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AREGP15514 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AREGP15514 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AREGP15514 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AREGP15514 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AREGP15514 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AREGP15514 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AREGP15514 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AREGP15514 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AREGP15514 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AREGP15514 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AREGP15514 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AREGP15514 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AREGP15514 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AREGP15514 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AREGP15514 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AREGP15514 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AREGP15514 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AREGP15514 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AREGP15514 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AREGP15514 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AREGP15514 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AREGP15514 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AREGP15514 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AREGP15514 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AREGP15514 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AREGP15514 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AREGP15514 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AREGP15514 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AREGP15514 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AREGP15514 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AREGP15514 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AREGP15514 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AREGP15514 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AREGP15514 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AREGP15514 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AREGP15514 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AREGP15514 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AREGP15514 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AREGP15514 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AREGP15514 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AREGP15514 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AREGP15514 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AREGP15514 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AREGP15514 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AREGP15514 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AREGP15514 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AREGP15514 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AREGP15514 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AREGP15514 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AREGP15514 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AREGP15514 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AREGP15514 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AREGP15514 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AREGP15514 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AREGP15514 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AREGP15514 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AREGP15514 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AREGP15514 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AREGP15514 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AREGP15514 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AREGP15514 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AREGP15514 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AREGP15514 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AREGP15514 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AREGP15514 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AREGP15514 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AREGP15514 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AREGP15514 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AREGP15514 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AREGP15514 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AREGP15514 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AREGP15514 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AREGP15514 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms