Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR2C1P13056 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR2C1P13056 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR2C1P13056 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NR2C1P13056 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR2C1P13056 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NR2C1P13056 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR2C1P13056 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR2C1P13056 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR2C1P13056 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NR2C1P13056 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NR2C1P13056 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR2C1P13056 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR2C1P13056 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR2C1P13056 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR2C1P13056 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR2C1P13056 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR2C1P13056 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR2C1P13056 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR2C1P13056 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C1P13056 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C1P13056 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C1P13056 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2C1P13056 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms