Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RLBP1P12271 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RLBP1P12271 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RLBP1P12271 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RLBP1P12271 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RLBP1P12271 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RLBP1P12271 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RLBP1P12271 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RLBP1P12271 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RLBP1P12271 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RLBP1P12271 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RLBP1P12271 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RLBP1P12271 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RLBP1P12271 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
RLBP1P12271 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RLBP1P12271 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RLBP1P12271 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RLBP1P12271 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
RLBP1P12271 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RLBP1P12271 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RLBP1P12271 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RLBP1P12271 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RLBP1P12271 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RLBP1P12271 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RLBP1P12271 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RLBP1P12271 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RLBP1P12271 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RLBP1P12271 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RLBP1P12271 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RLBP1P12271 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RLBP1P12271 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
RLBP1P12271 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RLBP1P12271 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RLBP1P12271 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RLBP1P12271 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RLBP1P12271 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RLBP1P12271 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RLBP1P12271 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RLBP1P12271 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RLBP1P12271 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RLBP1P12271 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RLBP1P12271 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RLBP1P12271 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RLBP1P12271 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RLBP1P12271 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RLBP1P12271 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RLBP1P12271 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms