Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL4AP11441 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL4AP11441 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4AP11441 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL4AP11441 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL4AP11441 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL4AP11441 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4AP11441 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBL4AP11441 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBL4AP11441 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBL4AP11441 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBL4AP11441 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBL4AP11441 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBL4AP11441 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBL4AP11441 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBL4AP11441 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBL4AP11441 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBL4AP11441 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBL4AP11441 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBL4AP11441 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBL4AP11441 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 491.3 ms