Protein–RNA interactions for Protein: P0CG01

GKN3P, Gastrokine-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN3PP0CG01 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKN3PP0CG01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN3PP0CG01 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN3PP0CG01 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GKN3PP0CG01 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GKN3PP0CG01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GKN3PP0CG01 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GKN3PP0CG01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GKN3PP0CG01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN3PP0CG01 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKN3PP0CG01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKN3PP0CG01 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GKN3PP0CG01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKN3PP0CG01 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN3PP0CG01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN3PP0CG01 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GKN3PP0CG01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN3PP0CG01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN3PP0CG01 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN3PP0CG01 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKN3PP0CG01 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GKN3PP0CG01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GKN3PP0CG01 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GKN3PP0CG01 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GKN3PP0CG01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GKN3PP0CG01 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN3PP0CG01 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN3PP0CG01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN3PP0CG01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GKN3PP0CG01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKN3PP0CG01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKN3PP0CG01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GKN3PP0CG01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GKN3PP0CG01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms