Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CT47B1P0C2W7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CT47B1P0C2W7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CT47B1P0C2W7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CT47B1P0C2W7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CT47B1P0C2W7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CT47B1P0C2W7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CT47B1P0C2W7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CT47B1P0C2W7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CT47B1P0C2W7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CT47B1P0C2W7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CT47B1P0C2W7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CT47B1P0C2W7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CT47B1P0C2W7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CT47B1P0C2W7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CT47B1P0C2W7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CT47B1P0C2W7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CT47B1P0C2W7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CT47B1P0C2W7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CT47B1P0C2W7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CT47B1P0C2W7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CT47B1P0C2W7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CT47B1P0C2W7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CT47B1P0C2W7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CT47B1P0C2W7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CT47B1P0C2W7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CT47B1P0C2W7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CT47B1P0C2W7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CT47B1P0C2W7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CT47B1P0C2W7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CT47B1P0C2W7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
CT47B1P0C2W7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CT47B1P0C2W7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CT47B1P0C2W7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CT47B1P0C2W7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CT47B1P0C2W7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CT47B1P0C2W7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CT47B1P0C2W7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CT47B1P0C2W7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CT47B1P0C2W7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CT47B1P0C2W7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CT47B1P0C2W7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms