Protein–RNA interactions for Protein: P0C025

NUDT17, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 17, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT17P0C025 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDT17P0C025 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUDT17P0C025 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUDT17P0C025 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDT17P0C025 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUDT17P0C025 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDT17P0C025 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDT17P0C025 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUDT17P0C025 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NUDT17P0C025 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUDT17P0C025 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDT17P0C025 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDT17P0C025 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDT17P0C025 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUDT17P0C025 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDT17P0C025 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUDT17P0C025 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUDT17P0C025 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUDT17P0C025 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUDT17P0C025 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUDT17P0C025 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUDT17P0C025 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms