Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TUBBP07437 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBBP07437 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBBP07437 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBBP07437 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBBP07437 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBBP07437 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBBP07437 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUBBP07437 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUBBP07437 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBBP07437 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBBP07437 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBBP07437 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBBP07437 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBBP07437 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBBP07437 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUBBP07437 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBBP07437 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBBP07437 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBBP07437 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBBP07437 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBBP07437 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBBP07437 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBBP07437 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBBP07437 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBBP07437 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBBP07437 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBBP07437 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBBP07437 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBBP07437 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBBP07437 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBBP07437 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBBP07437 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBBP07437 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBBP07437 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBBP07437 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBBP07437 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBBP07437 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBBP07437 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBBP07437 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBBP07437 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBBP07437 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBBP07437 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBBP07437 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBBP07437 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBBP07437 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBBP07437 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TUBBP07437 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBBP07437 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBBP07437 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBBP07437 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBBP07437 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBBP07437 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBBP07437 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBBP07437 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBBP07437 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBBP07437 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBBP07437 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBBP07437 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBBP07437 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TUBBP07437 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TUBBP07437 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBBP07437 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBBP07437 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBBP07437 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBBP07437 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBBP07437 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBBP07437 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBBP07437 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBBP07437 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBBP07437 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBBP07437 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBBP07437 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBBP07437 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBBP07437 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBBP07437 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBBP07437 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBBP07437 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBBP07437 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBBP07437 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBBP07437 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBBP07437 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBBP07437 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBBP07437 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBBP07437 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBBP07437 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBBP07437 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBBP07437 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBBP07437 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBBP07437 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBBP07437 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBBP07437 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBBP07437 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBBP07437 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBBP07437 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBBP07437 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBBP07437 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBBP07437 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBBP07437 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBBP07437 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms