Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-DQB1P01920 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DQB1P01920 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DQB1P01920 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DQB1P01920 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DQB1P01920 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DQB1P01920 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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