Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HLA-DQB1P01920 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLA-DQB1P01920 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HLA-DQB1P01920 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HLA-DQB1P01920 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HLA-DQB1P01920 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HLA-DQB1P01920 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HLA-DQB1P01920 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HLA-DQB1P01920 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HLA-DQB1P01920 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLA-DQB1P01920 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DQB1P01920 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DQB1P01920 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLA-DQB1P01920 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLA-DQB1P01920 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DQB1P01920 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DQB1P01920 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DQB1P01920 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DQB1P01920 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DQB1P01920 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-DQB1P01920 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HLA-DQB1P01920 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HLA-DQB1P01920 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DQB1P01920 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DQB1P01920 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HLA-DQB1P01920 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DQB1P01920 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DQB1P01920 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DQB1P01920 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HLA-DQB1P01920 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DQB1P01920 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DQB1P01920 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DQB1P01920 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DQB1P01920 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DQB1P01920 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DQB1P01920 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DQB1P01920 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DQB1P01920 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-DQB1P01920 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-DQB1P01920 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-DQB1P01920 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HLA-DQB1P01920 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DQB1P01920 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DQB1P01920 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HLA-DQB1P01920 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-DQB1P01920 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-DQB1P01920 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-DQB1P01920 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HLA-DQB1P01920 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-DQB1P01920 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DQB1P01920 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DQB1P01920 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DQB1P01920 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DQB1P01920 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DQB1P01920 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DQB1P01920 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DQB1P01920 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DQB1P01920 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DQB1P01920 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DQB1P01920 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DQB1P01920 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DQB1P01920 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DQB1P01920 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DQB1P01920 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DQB1P01920 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-DQB1P01920 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DQB1P01920 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DQB1P01920 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DQB1P01920 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DQB1P01920 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HLA-DQB1P01920 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DQB1P01920 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DQB1P01920 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DQB1P01920 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DQB1P01920 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-DQB1P01920 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-DQB1P01920 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HLA-DQB1P01920 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DQB1P01920 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-DQB1P01920 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DQB1P01920 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-DQB1P01920 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DQB1P01920 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DQB1P01920 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-DQB1P01920 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DQB1P01920 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DQB1P01920 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DQB1P01920 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DQB1P01920 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DQB1P01920 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DQB1P01920 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DQB1P01920 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DQB1P01920 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DQB1P01920 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DQB1P01920 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DQB1P01920 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DQB1P01920 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB1P01920 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB1P01920 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DQB1P01920 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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