Protein–RNA interactions for Protein: P01906

HLA-DQA2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA2P01906 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DQA2P01906 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DQA2P01906 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-DQA2P01906 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DQA2P01906 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DQA2P01906 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DQA2P01906 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DQA2P01906 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DQA2P01906 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQA2P01906 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQA2P01906 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-DQA2P01906 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DQA2P01906 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQA2P01906 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DQA2P01906 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQA2P01906 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DQA2P01906 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DQA2P01906 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DQA2P01906 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms