Protein–RNA interactions for Protein: P01906

HLA-DQA2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA2P01906 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HLA-DQA2P01906 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HLA-DQA2P01906 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HLA-DQA2P01906 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HLA-DQA2P01906 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HLA-DQA2P01906 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLA-DQA2P01906 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HLA-DQA2P01906 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HLA-DQA2P01906 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HLA-DQA2P01906 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLA-DQA2P01906 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HLA-DQA2P01906 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HLA-DQA2P01906 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HLA-DQA2P01906 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DQA2P01906 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HLA-DQA2P01906 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DQA2P01906 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DQA2P01906 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HLA-DQA2P01906 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HLA-DQA2P01906 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DQA2P01906 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DQA2P01906 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DQA2P01906 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HLA-DQA2P01906 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HLA-DQA2P01906 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DQA2P01906 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DQA2P01906 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-DQA2P01906 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-DQA2P01906 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DQA2P01906 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-DQA2P01906 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DQA2P01906 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-DQA2P01906 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HLA-DQA2P01906 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HLA-DQA2P01906 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HLA-DQA2P01906 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HLA-DQA2P01906 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HLA-DQA2P01906 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HLA-DQA2P01906 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DQA2P01906 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HLA-DQA2P01906 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HLA-DQA2P01906 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HLA-DQA2P01906 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DQA2P01906 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DQA2P01906 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HLA-DQA2P01906 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DQA2P01906 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DQA2P01906 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DQA2P01906 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DQA2P01906 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DQA2P01906 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-DQA2P01906 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-DQA2P01906 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-DQA2P01906 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DQA2P01906 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HLA-DQA2P01906 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-DQA2P01906 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-DQA2P01906 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HLA-DQA2P01906 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HLA-DQA2P01906 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-DQA2P01906 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-DQA2P01906 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-DQA2P01906 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLA-DQA2P01906 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-DQA2P01906 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-DQA2P01906 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DQA2P01906 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HLA-DQA2P01906 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DQA2P01906 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DQA2P01906 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DQA2P01906 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HLA-DQA2P01906 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DQA2P01906 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DQA2P01906 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DQA2P01906 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DQA2P01906 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DQA2P01906 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DQA2P01906 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DQA2P01906 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DQA2P01906 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DQA2P01906 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DQA2P01906 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DQA2P01906 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DQA2P01906 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DQA2P01906 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DQA2P01906 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-DQA2P01906 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DQA2P01906 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DQA2P01906 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DQA2P01906 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DQA2P01906 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-DQA2P01906 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DQA2P01906 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-DQA2P01906 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DQA2P01906 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-DQA2P01906 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLA-DQA2P01906 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HLA-DQA2P01906 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DQA2P01906 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HLA-DQA2P01906 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms