Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FARP2O94887 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FARP2O94887 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FARP2O94887 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FARP2O94887 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FARP2O94887 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FARP2O94887 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FARP2O94887 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FARP2O94887 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FARP2O94887 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FARP2O94887 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FARP2O94887 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
FARP2O94887 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FARP2O94887 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FARP2O94887 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FARP2O94887 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FARP2O94887 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FARP2O94887 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FARP2O94887 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FARP2O94887 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FARP2O94887 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FARP2O94887 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
FARP2O94887 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FARP2O94887 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FARP2O94887 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FARP2O94887 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FARP2O94887 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FARP2O94887 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FARP2O94887 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FARP2O94887 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FARP2O94887 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FARP2O94887 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FARP2O94887 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FARP2O94887 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FARP2O94887 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FARP2O94887 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FARP2O94887 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FARP2O94887 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FARP2O94887 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FARP2O94887 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FARP2O94887 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
FARP2O94887 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FARP2O94887 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FARP2O94887 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FARP2O94887 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FARP2O94887 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FARP2O94887 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FARP2O94887 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FARP2O94887 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
FARP2O94887 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FARP2O94887 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FARP2O94887 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FARP2O94887 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FARP2O94887 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FARP2O94887 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FARP2O94887 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FARP2O94887 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FARP2O94887 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FARP2O94887 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FARP2O94887 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FARP2O94887 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FARP2O94887 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FARP2O94887 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FARP2O94887 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FARP2O94887 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FARP2O94887 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FARP2O94887 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FARP2O94887 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FARP2O94887 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FARP2O94887 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FARP2O94887 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FARP2O94887 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FARP2O94887 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FARP2O94887 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FARP2O94887 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FARP2O94887 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FARP2O94887 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FARP2O94887 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FARP2O94887 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FARP2O94887 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FARP2O94887 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
FARP2O94887 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FARP2O94887 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
FARP2O94887 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FARP2O94887 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FARP2O94887 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
FARP2O94887 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
FARP2O94887 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
FARP2O94887 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FARP2O94887 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FARP2O94887 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FARP2O94887 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FARP2O94887 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FARP2O94887 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FARP2O94887 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FARP2O94887 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FARP2O94887 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FARP2O94887 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FARP2O94887 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FARP2O94887 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms