Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP9O75884 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP9O75884 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP9O75884 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBBP9O75884 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBBP9O75884 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP9O75884 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBBP9O75884 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBBP9O75884 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP9O75884 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBBP9O75884 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBBP9O75884 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBBP9O75884 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP9O75884 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP9O75884 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP9O75884 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP9O75884 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP9O75884 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP9O75884 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms