Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
JRKO75564 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
JRKO75564 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
JRKO75564 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
JRKO75564 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
JRKO75564 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
JRKO75564 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
JRKO75564 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
JRKO75564 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
JRKO75564 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
JRKO75564 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
JRKO75564 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
JRKO75564 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
JRKO75564 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
JRKO75564 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
JRKO75564 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
JRKO75564 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
JRKO75564 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
JRKO75564 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
JRKO75564 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
JRKO75564 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
JRKO75564 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
JRKO75564 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
JRKO75564 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
JRKO75564 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
JRKO75564 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
JRKO75564 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
JRKO75564 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
JRKO75564 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
JRKO75564 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
JRKO75564 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
JRKO75564 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
JRKO75564 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
JRKO75564 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
JRKO75564 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
JRKO75564 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
JRKO75564 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
JRKO75564 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
JRKO75564 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
JRKO75564 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
JRKO75564 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
JRKO75564 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
JRKO75564 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
JRKO75564 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
JRKO75564 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
JRKO75564 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
JRKO75564 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
JRKO75564 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
JRKO75564 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
JRKO75564 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
JRKO75564 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
JRKO75564 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
JRKO75564 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
JRKO75564 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
JRKO75564 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
JRKO75564 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
JRKO75564 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
JRKO75564 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
JRKO75564 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
JRKO75564 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
JRKO75564 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
JRKO75564 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
JRKO75564 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
JRKO75564 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
JRKO75564 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
JRKO75564 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
JRKO75564 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
JRKO75564 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
JRKO75564 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
JRKO75564 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
JRKO75564 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
JRKO75564 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
JRKO75564 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
JRKO75564 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
JRKO75564 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
JRKO75564 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
JRKO75564 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
JRKO75564 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
JRKO75564 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
JRKO75564 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
JRKO75564 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
JRKO75564 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
JRKO75564 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
JRKO75564 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
JRKO75564 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
JRKO75564 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
JRKO75564 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
JRKO75564 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
JRKO75564 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
JRKO75564 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
JRKO75564 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
JRKO75564 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
JRKO75564 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
JRKO75564 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
JRKO75564 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
JRKO75564 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
JRKO75564 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
JRKO75564 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
JRKO75564 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
JRKO75564 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms