Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC22BO75396 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC22BO75396 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC22BO75396 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC22BO75396 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC22BO75396 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEC22BO75396 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC22BO75396 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC22BO75396 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC22BO75396 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC22BO75396 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC22BO75396 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC22BO75396 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC22BO75396 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC22BO75396 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC22BO75396 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC22BO75396 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC22BO75396 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC22BO75396 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms