Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB7O75200 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB7O75200 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB7O75200 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB7O75200 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB7O75200 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPB7O75200 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPB7O75200 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPIPB7O75200 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPIPB7O75200 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPIPB7O75200 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms