Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG13O75143 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG13O75143 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG13O75143 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG13O75143 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG13O75143 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG13O75143 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG13O75143 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG13O75143 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG13O75143 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG13O75143 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG13O75143 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG13O75143 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG13O75143 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG13O75143 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG13O75143 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG13O75143 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG13O75143 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG13O75143 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG13O75143 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG13O75143 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG13O75143 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG13O75143 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG13O75143 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG13O75143 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATG13O75143 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG13O75143 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG13O75143 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG13O75143 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG13O75143 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG13O75143 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG13O75143 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG13O75143 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG13O75143 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG13O75143 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG13O75143 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG13O75143 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG13O75143 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG13O75143 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG13O75143 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG13O75143 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG13O75143 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG13O75143 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG13O75143 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG13O75143 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG13O75143 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG13O75143 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG13O75143 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG13O75143 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG13O75143 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG13O75143 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG13O75143 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG13O75143 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG13O75143 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG13O75143 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG13O75143 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG13O75143 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG13O75143 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG13O75143 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG13O75143 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG13O75143 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG13O75143 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG13O75143 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG13O75143 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG13O75143 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG13O75143 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATG13O75143 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG13O75143 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG13O75143 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG13O75143 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG13O75143 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG13O75143 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATG13O75143 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG13O75143 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATG13O75143 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG13O75143 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG13O75143 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATG13O75143 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG13O75143 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATG13O75143 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG13O75143 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG13O75143 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG13O75143 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG13O75143 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG13O75143 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG13O75143 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG13O75143 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG13O75143 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG13O75143 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG13O75143 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG13O75143 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG13O75143 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG13O75143 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG13O75143 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG13O75143 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG13O75143 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG13O75143 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG13O75143 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG13O75143 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG13O75143 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms