Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5O60239 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5O60239 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5O60239 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH3BP5O60239 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH3BP5O60239 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH3BP5O60239 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3BP5O60239 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH3BP5O60239 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH3BP5O60239 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SH3BP5O60239 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3BP5O60239 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3BP5O60239 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3BP5O60239 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3BP5O60239 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BP5O60239 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH3BP5O60239 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3BP5O60239 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3BP5O60239 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BP5O60239 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BP5O60239 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BP5O60239 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BP5O60239 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5O60239 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BP5O60239 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3BP5O60239 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms