Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM6AO15550 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM6AO15550 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM6AO15550 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM6AO15550 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM6AO15550 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
KDM6AO15550 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM6AO15550 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM6AO15550 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KDM6AO15550 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
KDM6AO15550 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
KDM6AO15550 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KDM6AO15550 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KDM6AO15550 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM6AO15550 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
KDM6AO15550 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KDM6AO15550 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
KDM6AO15550 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM6AO15550 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM6AO15550 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM6AO15550 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KDM6AO15550 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM6AO15550 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM6AO15550 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM6AO15550 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM6AO15550 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM6AO15550 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM6AO15550 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM6AO15550 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM6AO15550 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM6AO15550 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM6AO15550 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM6AO15550 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6AO15550 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM6AO15550 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM6AO15550 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM6AO15550 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM6AO15550 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM6AO15550 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM6AO15550 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
KDM6AO15550 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
KDM6AO15550 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM6AO15550 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM6AO15550 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM6AO15550 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM6AO15550 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms