Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-8O15522 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-8O15522 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-8O15522 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-8O15522 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKX2-8O15522 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKX2-8O15522 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX2-8O15522 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKX2-8O15522 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX2-8O15522 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX2-8O15522 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKX2-8O15522 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX2-8O15522 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX2-8O15522 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX2-8O15522 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX2-8O15522 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX2-8O15522 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX2-8O15522 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX2-8O15522 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKX2-8O15522 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX2-8O15522 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKX2-8O15522 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKX2-8O15522 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX2-8O15522 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX2-8O15522 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKX2-8O15522 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKX2-8O15522 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms