Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHUKO15111 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHUKO15111 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHUKO15111 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHUKO15111 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHUKO15111 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHUKO15111 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHUKO15111 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHUKO15111 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CHUKO15111 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CHUKO15111 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHUKO15111 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHUKO15111 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHUKO15111 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHUKO15111 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHUKO15111 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHUKO15111 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHUKO15111 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHUKO15111 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHUKO15111 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHUKO15111 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHUKO15111 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHUKO15111 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHUKO15111 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHUKO15111 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHUKO15111 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHUKO15111 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHUKO15111 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHUKO15111 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHUKO15111 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHUKO15111 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHUKO15111 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHUKO15111 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHUKO15111 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHUKO15111 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHUKO15111 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHUKO15111 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHUKO15111 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHUKO15111 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHUKO15111 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHUKO15111 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHUKO15111 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHUKO15111 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHUKO15111 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHUKO15111 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHUKO15111 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHUKO15111 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHUKO15111 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHUKO15111 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHUKO15111 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHUKO15111 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHUKO15111 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHUKO15111 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHUKO15111 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHUKO15111 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHUKO15111 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHUKO15111 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHUKO15111 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHUKO15111 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHUKO15111 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHUKO15111 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHUKO15111 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHUKO15111 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHUKO15111 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHUKO15111 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHUKO15111 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHUKO15111 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHUKO15111 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHUKO15111 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHUKO15111 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHUKO15111 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHUKO15111 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHUKO15111 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHUKO15111 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHUKO15111 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHUKO15111 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHUKO15111 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHUKO15111 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHUKO15111 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHUKO15111 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHUKO15111 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHUKO15111 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHUKO15111 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHUKO15111 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHUKO15111 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHUKO15111 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHUKO15111 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHUKO15111 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHUKO15111 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHUKO15111 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHUKO15111 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHUKO15111 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHUKO15111 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHUKO15111 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHUKO15111 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHUKO15111 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHUKO15111 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHUKO15111 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHUKO15111 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHUKO15111 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms