Protein–RNA interactions for Protein: O15016

TRIM66, Tripartite motif-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM66O15016 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM66O15016 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM66O15016 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM66O15016 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM66O15016 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM66O15016 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM66O15016 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM66O15016 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM66O15016 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM66O15016 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM66O15016 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM66O15016 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM66O15016 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM66O15016 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM66O15016 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM66O15016 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM66O15016 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM66O15016 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM66O15016 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM66O15016 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM66O15016 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms