Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCKDKO14874 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCKDKO14874 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCKDKO14874 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCKDKO14874 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCKDKO14874 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCKDKO14874 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCKDKO14874 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BCKDKO14874 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms