Protein–RNA interactions for Protein: O14786

NRP1, Neuropilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRP1O14786 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRP1O14786 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRP1O14786 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRP1O14786 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRP1O14786 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRP1O14786 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRP1O14786 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRP1O14786 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRP1O14786 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRP1O14786 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRP1O14786 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRP1O14786 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRP1O14786 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRP1O14786 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRP1O14786 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRP1O14786 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRP1O14786 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRP1O14786 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRP1O14786 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NRP1O14786 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRP1O14786 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRP1O14786 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRP1O14786 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NRP1O14786 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRP1O14786 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRP1O14786 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRP1O14786 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRP1O14786 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRP1O14786 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRP1O14786 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRP1O14786 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRP1O14786 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRP1O14786 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRP1O14786 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRP1O14786 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NRP1O14786 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRP1O14786 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRP1O14786 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRP1O14786 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRP1O14786 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRP1O14786 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRP1O14786 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRP1O14786 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRP1O14786 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRP1O14786 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRP1O14786 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRP1O14786 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRP1O14786 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NRP1O14786 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRP1O14786 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRP1O14786 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRP1O14786 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRP1O14786 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRP1O14786 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRP1O14786 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRP1O14786 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRP1O14786 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRP1O14786 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRP1O14786 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRP1O14786 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRP1O14786 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRP1O14786 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRP1O14786 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRP1O14786 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRP1O14786 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRP1O14786 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRP1O14786 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRP1O14786 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRP1O14786 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRP1O14786 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRP1O14786 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRP1O14786 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRP1O14786 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRP1O14786 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRP1O14786 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRP1O14786 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRP1O14786 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRP1O14786 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRP1O14786 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NRP1O14786 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NRP1O14786 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NRP1O14786 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRP1O14786 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRP1O14786 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRP1O14786 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRP1O14786 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRP1O14786 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRP1O14786 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRP1O14786 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRP1O14786 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRP1O14786 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRP1O14786 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRP1O14786 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRP1O14786 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRP1O14786 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NRP1O14786 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NRP1O14786 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NRP1O14786 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRP1O14786 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRP1O14786 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms