Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR4O00206 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR4O00206 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TLR4O00206 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TLR4O00206 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TLR4O00206 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TLR4O00206 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TLR4O00206 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TLR4O00206 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TLR4O00206 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TLR4O00206 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TLR4O00206 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TLR4O00206 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TLR4O00206 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TLR4O00206 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TLR4O00206 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TLR4O00206 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR4O00206 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TLR4O00206 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TLR4O00206 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TLR4O00206 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR4O00206 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR4O00206 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR4O00206 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR4O00206 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR4O00206 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TLR4O00206 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TLR4O00206 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TLR4O00206 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TLR4O00206 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TLR4O00206 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TLR4O00206 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TLR4O00206 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TLR4O00206 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TLR4O00206 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TLR4O00206 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TLR4O00206 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TLR4O00206 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR4O00206 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR4O00206 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR4O00206 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TLR4O00206 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR4O00206 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR4O00206 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR4O00206 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR4O00206 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLR4O00206 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLR4O00206 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLR4O00206 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLR4O00206 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TLR4O00206 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TLR4O00206 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TLR4O00206 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TLR4O00206 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TLR4O00206 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TLR4O00206 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TLR4O00206 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TLR4O00206 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TLR4O00206 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TLR4O00206 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TLR4O00206 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TLR4O00206 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TLR4O00206 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TLR4O00206 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TLR4O00206 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TLR4O00206 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TLR4O00206 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TLR4O00206 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TLR4O00206 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TLR4O00206 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TLR4O00206 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TLR4O00206 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TLR4O00206 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TLR4O00206 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TLR4O00206 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TLR4O00206 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TLR4O00206 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TLR4O00206 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TLR4O00206 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TLR4O00206 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TLR4O00206 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TLR4O00206 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TLR4O00206 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TLR4O00206 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TLR4O00206 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TLR4O00206 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TLR4O00206 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TLR4O00206 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TLR4O00206 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLR4O00206 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLR4O00206 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TLR4O00206 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TLR4O00206 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TLR4O00206 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TLR4O00206 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TLR4O00206 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TLR4O00206 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TLR4O00206 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLR4O00206 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLR4O00206 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 718.4 ms