Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3KRW8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3KRW8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3KRW8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3KRW8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3KRW8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KRW8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KRW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KRW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KRW8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KRW8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KRW8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KRW8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KRW8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KRW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KRW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KRW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KRW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KRW8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KRW8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KRW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KRW8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KRW8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KRW8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KRW8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KRW8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KRW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KRW8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KRW8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3KRW8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KRW8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3KRW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KRW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3KRW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KRW8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3KRW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
J3KRW8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KRW8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3KRW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KRW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KRW8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3KRW8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KRW8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3KRW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KRW8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KRW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KRW8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KRW8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KRW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KRW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3KRW8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KRW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KRW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KRW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3KRW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KRW8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KRW8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3KRW8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KRW8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3KRW8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KRW8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KRW8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KRW8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KRW8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KRW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KRW8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KRW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KRW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KRW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KRW8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KRW8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KRW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KRW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KRW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KRW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KRW8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KRW8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KRW8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3KRW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3KRW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KRW8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KRW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3KRW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KRW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KRW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KRW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KRW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KRW8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KRW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KRW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KRW8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KRW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KRW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KRW8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KRW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KRW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KRW8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KRW8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KRW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KRW8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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