Protein–RNA interactions for Protein: F8WDY8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8WDY8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F8WDY8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F8WDY8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8WDY8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8WDY8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8WDY8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8WDY8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8WDY8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F8WDY8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F8WDY8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8WDY8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F8WDY8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F8WDY8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
F8WDY8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8WDY8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8WDY8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8WDY8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8WDY8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8WDY8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8WDY8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8WDY8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8WDY8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8WDY8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8WDY8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8WDY8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
F8WDY8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8WDY8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8WDY8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8WDY8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8WDY8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8WDY8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8WDY8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8WDY8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8WDY8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8WDY8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F8WDY8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
F8WDY8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
F8WDY8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
F8WDY8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
F8WDY8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
F8WDY8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8WDY8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8WDY8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8WDY8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8WDY8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8WDY8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8WDY8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8WDY8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8WDY8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8WDY8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8WDY8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8WDY8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8WDY8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8WDY8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8WDY8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8WDY8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8WDY8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8WDY8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8WDY8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8WDY8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8WDY8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms