Protein–RNA interactions for Protein: C9J1V9

EEF1E1-BLOC1S5, EEF1E1-BLOC1S5 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms