Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NL46 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NL46 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A6NL46 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NL46 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NL46 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NL46 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A6NL46 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A6NL46 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A6NL46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A6NL46 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A6NL46 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A6NL46 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
A6NL46 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A6NL46 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
A6NL46 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A6NL46 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A6NL46 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A6NL46 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
A6NL46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A6NL46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A6NL46 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A6NL46 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A6NL46 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A6NL46 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
A6NL46 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A6NL46 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A6NL46 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A6NL46 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A6NL46 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A6NL46 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A6NL46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NL46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NL46 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NL46 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NL46 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NL46 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NL46 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NL46 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A6NL46 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A6NL46 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A6NL46 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NL46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NL46 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NL46 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NL46 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A6NL46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A6NL46 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A6NL46 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A6NL46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NL46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A6NL46 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A6NL46 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A6NL46 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A6NL46 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A6NL46 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A6NL46 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A6NL46 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A6NL46 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A6NL46 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A6NL46 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A6NL46 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A6NL46 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A6NL46 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A6NL46 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A6NL46 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A6NL46 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A6NL46 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A6NL46 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A6NL46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A6NL46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A6NL46 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A6NL46 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A6NL46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A6NL46 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A6NL46 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A6NL46 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A6NL46 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A6NL46 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A6NL46 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A6NL46 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A6NL46 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A6NL46 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A6NL46 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A6NL46 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A6NL46 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
A6NL46 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
A6NL46 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A6NL46 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A6NL46 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A6NL46 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A6NL46 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A6NL46 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A6NL46 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A6NL46 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A6NL46 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A6NL46 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A6NL46 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A6NL46 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A6NL46 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms