Protein–RNA interactions for Protein: A6NFF2

NAP1L6, Putative nucleosome assembly protein 1-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L6A6NFF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L6A6NFF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L6A6NFF2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L6A6NFF2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L6A6NFF2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L6A6NFF2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L6A6NFF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L6A6NFF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L6A6NFF2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAP1L6A6NFF2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L6A6NFF2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L6A6NFF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L6A6NFF2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L6A6NFF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAP1L6A6NFF2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L6A6NFF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L6A6NFF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAP1L6A6NFF2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L6A6NFF2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L6A6NFF2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NAP1L6A6NFF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L6A6NFF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L6A6NFF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms