Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf51A6NDU8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf51A6NDU8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf51A6NDU8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C5orf51A6NDU8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C5orf51A6NDU8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf51A6NDU8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C5orf51A6NDU8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf51A6NDU8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C5orf51A6NDU8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C5orf51A6NDU8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf51A6NDU8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf51A6NDU8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf51A6NDU8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf51A6NDU8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf51A6NDU8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf51A6NDU8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf51A6NDU8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf51A6NDU8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf51A6NDU8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf51A6NDU8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms