Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP69A5D8W1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP69A5D8W1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms