Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC66A2RUB6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC66A2RUB6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC66A2RUB6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC66A2RUB6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC66A2RUB6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC66A2RUB6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC66A2RUB6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC66A2RUB6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC66A2RUB6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC66A2RUB6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC66A2RUB6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC66A2RUB6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC66A2RUB6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC66A2RUB6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC66A2RUB6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC66A2RUB6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC66A2RUB6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC66A2RUB6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC66A2RUB6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC66A2RUB6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC66A2RUB6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC66A2RUB6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC66A2RUB6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC66A2RUB6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC66A2RUB6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC66A2RUB6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC66A2RUB6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC66A2RUB6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC66A2RUB6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC66A2RUB6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC66A2RUB6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC66A2RUB6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC66A2RUB6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC66A2RUB6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC66A2RUB6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC66A2RUB6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC66A2RUB6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC66A2RUB6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC66A2RUB6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms