Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYCE3A1L190 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCE3A1L190 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCE3A1L190 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCE3A1L190 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCE3A1L190 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCE3A1L190 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCE3A1L190 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCE3A1L190 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCE3A1L190 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCE3A1L190 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCE3A1L190 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCE3A1L190 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYCE3A1L190 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCE3A1L190 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCE3A1L190 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCE3A1L190 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCE3A1L190 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCE3A1L190 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCE3A1L190 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYCE3A1L190 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCE3A1L190 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCE3A1L190 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCE3A1L190 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCE3A1L190 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms