Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1B0GTW7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A1B0GTW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A1B0GTW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1B0GTW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A1B0GTW7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A1B0GTW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A1B0GTW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms